מכון בריין טריין כולל עמדות מחשב שמאפשרות גישה למבחר מעודכן של התוכנות הטובות ביותר בתחום. כל מתאמן עובר שלושה שלבים: 1. שלב ההערכה - עם ההצטרפות למכון, עובר כל מתאמן שלב זה שעיקרו הערכת יכולתו הקוגניטיבית של האדם בחתכים שונים: זיכרון, קשב וריכוז, תפיסה מרחבית, קבלת החלטות ומהירות תגובה. משך ההערכה הוא כשעה, ומטרתה לספק מידע מהימן לצורך תכנון האימון ומעקב אחר התקדמות המתאמן. 2. בניית תכנית אימון אישית – לאחר שלב ההערכה, נבנית תוכנית אימון אישית שתפורה באופן אישי לצרכיו של כל מתאמן. התוכנית מורכבת ממגוון של עשרות תוכנות שנבדקו והוכחו מדעית ותפקידן מוגדר - לאמן את המוח ולשפר את היכולות הקוגניטיביות. המערכת לומדת את ביצועי המשתמש והתקדמותו, ומספקת מגוון רחב של משובים. 3. בחינת התקדמות תקופתית - משוב - כשלושה חודשים לאחר תחילת האימון, מתבצעת הערכה מחודשת של המדדים הקוגניטיבים ונמדדת התקדמותו של המתאמן בכל אחת מהיכולות השונות. באמצעות הערכה זו, נבנית תוכנית האימונים הבאה. בכל השלבים מלווה את המתאמן מדריך אישי שקשוב להתקדמות המתאמן ולהעדפות שלו. מלבד תוכנות מחשב, עומדים אמצעים נוספים המאתגרים פעילות מוחית לרשות הלקוחות לשימוש עצמי: משחקי מחשבה וזיכרון (לקבוצות וליחידים), ספרות מקצועית מהתחום ועוד.